文章出現在 PubMed 中有三種方式：
1. 如果文章是發佈在為 MEDLINE 編入索引的期刊上。
2. 如果文章是發表在已被接受納入 PubMed Central 的期刊上。
3. 如果文章是由 PubMed 接受的資助機構資助的。
注意：在2019 年 1月，PubMed 修改了其將開放獲取文獻納入 PubMed 中的政策。直到 2018 年 12 月，所有在 Springer Nature 期刊上發表的開放獲取文獻都會自動收錄到 PubMed 中。本政策自 2019 年 1 月起修訂後，在 MEDLINE 索引期刊上發表的文章被收錄到 PubMed 中。